AlphaFold 3 预测生命分子结构和相互作用

什么是 AlphaFold 3

AlphaFold 3 是由 Google DeepMind 和 Isomorphic Labs 开发的新型 AI 模型。通过准确预测蛋白质、DNA、RNA 和配体等分子的结构及其相互作用，我们希望它能彻底改变我们对生物世界和药物发现的理解。

特点

高精度结构预测

在一篇发表在《Nature》上的论文中，我们介绍了 AlphaFold 3，这是一种革命性的模型，能够以前所未有的精度预测所有生命分子的结构和相互作用。与现有的预测方法相比，蛋白质与其他分子类型的相互作用预测提高了至少 50%，而在某些重要类别的相互作用预测中，准确度翻了一番。

深度学习架构

AlphaFold 3 的能力来自其覆盖所有生命分子的下一代架构和训练。模型核心是改进版的 Evoformer 模块，这是支撑 AlphaFold 2 出色性能的深度学习架构。AlphaFold 3 通过扩散网络组装其预测，这种网络类似于 AI 图像生成器中的扩散过程。

药物发现应用

AlphaFold 3 能够前所未有地准确预测药物相似物的相互作用，包括蛋白质与配体的结合及抗体与靶蛋白的结合。Isomorphic Labs 正在利用 AlphaFold 3 加速和改进药物设计的成功率，通过帮助理解如何接近新的疾病目标，并开发以前无法实现的新方法来追求现有目标。

使用案例

科学家们可以通过我们新推出的 AlphaFold Server 免费访问其大部分功能，这是一种易于使用的研究工具。Isomorphic Labs 已经在与制药公司合作，将其应用于现实世界的药物设计挑战，并最终为患者开发新的改变生活的治疗方法。

常见问题解答

AlphaFold 3 如何揭示生命分子？

给定一个分子列表，AlphaFold 3 会生成它们的联合 3D 结构，揭示它们如何组合在一起。它可以建模大型生物分子，如蛋白质、DNA 和 RNA，以及小分子（也称为配体）。此外，AlphaFold 3 还能建模这些分子的化学修饰，这些修饰控制细胞的健康功能，当它们被破坏时可能导致疾病。

AlphaFold Server 是什么？

AlphaFold Server 是一种免费的平台，全球科学家可以使用它进行非商业研究。只需点击几下，生物学家就可以利用 AlphaFold 3 的力量来建模由蛋白质、DNA、RNA 和一系列配体、离子及化学修饰组成的结构。